Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD1P28340 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD1P28340 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD1P28340 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD1P28340 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD1P28340 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD1P28340 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD1P28340 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD1P28340 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD1P28340 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD1P28340 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD1P28340 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD1P28340 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD1P28340 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD1P28340 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD1P28340 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD1P28340 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD1P28340 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD1P28340 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD1P28340 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD1P28340 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD1P28340 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD1P28340 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
POLD1P28340 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD1P28340 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD1P28340 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD1P28340 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD1P28340 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD1P28340 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD1P28340 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD1P28340 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD1P28340 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD1P28340 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD1P28340 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD1P28340 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD1P28340 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD1P28340 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD1P28340 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD1P28340 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD1P28340 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD1P28340 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD1P28340 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD1P28340 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD1P28340 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD1P28340 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD1P28340 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD1P28340 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD1P28340 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD1P28340 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD1P28340 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD1P28340 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD1P28340 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD1P28340 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD1P28340 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD1P28340 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD1P28340 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD1P28340 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD1P28340 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD1P28340 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD1P28340 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
POLD1P28340 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD1P28340 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD1P28340 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD1P28340 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD1P28340 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD1P28340 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD1P28340 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD1P28340 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD1P28340 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD1P28340 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD1P28340 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD1P28340 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD1P28340 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD1P28340 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD1P28340 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD1P28340 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD1P28340 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD1P28340 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD1P28340 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD1P28340 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD1P28340 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD1P28340 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD1P28340 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD1P28340 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD1P28340 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD1P28340 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD1P28340 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD1P28340 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD1P28340 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD1P28340 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD1P28340 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD1P28340 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD1P28340 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD1P28340 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
POLD1P28340 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD1P28340 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD1P28340 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD1P28340 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD1P28340 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
POLD1P28340 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms