Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DNMT1P26358 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
DNMT1P26358 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms