Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SFTPCP11686 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SFTPCP11686 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SFTPCP11686 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SFTPCP11686 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SFTPCP11686 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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SFTPCP11686 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SFTPCP11686 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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