Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PTPRCP08575 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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