Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GOLGA8SH3BPF8 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms