Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y446

PKP3, Plakophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3Q9Y446 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PKP3Q9Y446 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms