Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S0

POLR1D, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, humanhuman

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Length 133 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1DQ9Y2S0 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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POLR1DQ9Y2S0 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
POLR1DQ9Y2S0 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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