Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMR7

CLEC4A, C-type lectin domain family 4 member A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4AQ9UMR7 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CLEC4AQ9UMR7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms