Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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MIS18AQ9NYP9 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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MIS18AQ9NYP9 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
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MIS18AQ9NYP9 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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MIS18AQ9NYP9 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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MIS18AQ9NYP9 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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MIS18AQ9NYP9 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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MIS18AQ9NYP9 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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MIS18AQ9NYP9 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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MIS18AQ9NYP9 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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MIS18AQ9NYP9 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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MIS18AQ9NYP9 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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MIS18AQ9NYP9 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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MIS18AQ9NYP9 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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MIS18AQ9NYP9 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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MIS18AQ9NYP9 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MIS18AQ9NYP9 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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