Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TBCCD1Q9NVR7 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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