Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.05■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
MED17Q9NVC6 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.05■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.04■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.03■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
MED17Q9NVC6 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms