Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG3Q9NT62 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms