Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RIOK2Q9BVS4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RIOK2Q9BVS4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms