Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SGF29Q96ES7 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms