Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HDAC11Q96DB2 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms