Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMPDL3AQ92484 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms