Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ZNF439Q8NDP4 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms