Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 DNM1P51-201ENST00000558149 522 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STRCQ7RTU9 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms