Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SLC27A3Q5K4L6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms