Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NBPF1Q3BBV0 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NBPF1Q3BBV0 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms