Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CCDC85BQ15834 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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