Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms