Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RFTN1Q14699 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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