Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IRF5Q13568 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms