Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BNIP1Q12981 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms