Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LMAN2Q12907 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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