Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
BPTFQ12830 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BPTFQ12830 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
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