Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GABPAQ06546 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms