Protein–RNA interactions for Protein: Q04721

NOTCH2, Neurogenic locus notch homolog protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH2Q04721 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
NOTCH2Q04721 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NOTCH2Q04721 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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