Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN2Q02246 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN2Q02246 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN2Q02246 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN2Q02246 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN2Q02246 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN2Q02246 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN2Q02246 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN2Q02246 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN2Q02246 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN2Q02246 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN2Q02246 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN2Q02246 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN2Q02246 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN2Q02246 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN2Q02246 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN2Q02246 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN2Q02246 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN2Q02246 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN2Q02246 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN2Q02246 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN2Q02246 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN2Q02246 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN2Q02246 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN2Q02246 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN2Q02246 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN2Q02246 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN2Q02246 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN2Q02246 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN2Q02246 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN2Q02246 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN2Q02246 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN2Q02246 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN2Q02246 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN2Q02246 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN2Q02246 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN2Q02246 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN2Q02246 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN2Q02246 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTN2Q02246 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms