Protein–RNA interactions for Protein: P62701

RPS4X, 40S ribosomal protein S4, X isoform, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4XP62701 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPS4XP62701 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPS4XP62701 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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