Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms