Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO2P25791 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO2P25791 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO2P25791 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO2P25791 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO2P25791 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO2P25791 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO2P25791 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO2P25791 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO2P25791 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO2P25791 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO2P25791 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO2P25791 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO2P25791 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO2P25791 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO2P25791 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO2P25791 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO2P25791 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO2P25791 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO2P25791 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO2P25791 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO2P25791 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO2P25791 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO2P25791 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO2P25791 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO2P25791 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO2P25791 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO2P25791 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO2P25791 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LMO2P25791 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO2P25791 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO2P25791 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO2P25791 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO2P25791 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO2P25791 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO2P25791 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO2P25791 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO2P25791 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO2P25791 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO2P25791 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO2P25791 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO2P25791 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO2P25791 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO2P25791 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO2P25791 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO2P25791 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO2P25791 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO2P25791 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO2P25791 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO2P25791 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO2P25791 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO2P25791 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO2P25791 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO2P25791 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO2P25791 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO2P25791 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO2P25791 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO2P25791 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO2P25791 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO2P25791 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO2P25791 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO2P25791 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO2P25791 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO2P25791 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO2P25791 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO2P25791 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LMO2P25791 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO2P25791 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO2P25791 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO2P25791 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO2P25791 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO2P25791 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO2P25791 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO2P25791 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO2P25791 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO2P25791 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO2P25791 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO2P25791 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO2P25791 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO2P25791 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO2P25791 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO2P25791 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO2P25791 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO2P25791 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO2P25791 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO2P25791 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO2P25791 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO2P25791 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO2P25791 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO2P25791 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO2P25791 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO2P25791 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO2P25791 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO2P25791 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO2P25791 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO2P25791 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO2P25791 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO2P25791 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO2P25791 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LMO2P25791 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms