Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
PSMA4P25789 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PSMA4P25789 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PSMA4P25789 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PSMA4P25789 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
PSMA4P25789 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PSMA4P25789 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PSMA4P25789 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PSMA4P25789 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PSMA4P25789 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
PSMA4P25789 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
PSMA4P25789 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMA4P25789 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMA4P25789 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMA4P25789 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMA4P25789 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMA4P25789 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMA4P25789 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
PSMA4P25789 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms