Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRPH2P23942 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms