Protein–RNA interactions for Protein: P21953

BCKDHB, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHBP21953 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BCKDHBP21953 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms