Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PGA3P0DJD8 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
PGA3P0DJD8 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms