Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF888P0CJ79 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZNF888P0CJ79 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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