Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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HOXA3O43365 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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HOXA3O43365 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HOXA3O43365 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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