Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.692e-9■□□□□ 9.7
PRPF4O43172 ACADM-206ENST00000525808 1422 ntTSL 24.42□□□□□ -1.71e-9■□□□□ 9.7
PRPF4O43172 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.761e-9■□□□□ 9.7
PRPF4O43172 ACADM-209ENST00000526196 1451 ntTSL 1 (best)3.86□□□□□ -1.791e-9■□□□□ 9.7
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PRPF4O43172 DNPEP-221ENST00000523527 565 ntTSL 215.61■□□□□ 0.093e-7■□□□□ 9.7
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PRPF4O43172 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.341e-10■□□□□ 9.7
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PRPF4O43172 RPL13-210ENST00000562879 958 ntTSL 1 (best)14.47□□□□□ -0.091e-10■□□□□ 9.7
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PRPF4O43172 RPL13-201ENST00000311528 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.421e-10■□□□□ 9.7
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PRPF4O43172 ITPR2-204ENST00000536627 569 ntTSL 44.43□□□□□ -1.71e-9■□□□□ 9.6
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PRPF4O43172 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.322e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.042e-8■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 PKM-205ENST00000561609 1568 ntTSL 1 (best)11.45□□□□□ -0.582e-8■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.194e-8■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 FOSL2-204ENST00000460736 393 ntTSL 512.44□□□□□ -0.424e-8■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 FOSL2-202ENST00000379619 5829 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.444e-8■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 PLXNB1-205ENST00000461261 851 ntTSL 511.14□□□□□ -0.638e-10■□□□□ 9.5
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PRPF4O43172 CERS2-213ENST00000560793 1661 ntTSL 1 (best)9.74□□□□□ -0.851e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 MZT2A-204ENST00000445782 980 ntTSL 225.5■■□□□ 1.671e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 ZSCAN29-203ENST00000561661 643 ntTSL 324.38■■□□□ 1.491e-6■□□□□ 9.5
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PRPF4O43172 C7orf43-203ENST00000419037 2200 ntTSL 523.29■■□□□ 1.321e-6■□□□□ 9.5
PRPF4O43172 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.241e-6■□□□□ 9.5
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