Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SYNJ2O15056 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNJ2O15056 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms