Protein–RNA interactions for Protein: O00267

SUPT5H, Transcription elongation factor SPT5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT5HO00267 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SUPT5HO00267 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SUPT5HO00267 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SUPT5HO00267 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SUPT5HO00267 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SUPT5HO00267 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SUPT5HO00267 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SUPT5HO00267 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SUPT5HO00267 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SUPT5HO00267 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SUPT5HO00267 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SUPT5HO00267 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
SUPT5HO00267 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SUPT5HO00267 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SUPT5HO00267 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SUPT5HO00267 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SUPT5HO00267 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SUPT5HO00267 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SUPT5HO00267 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
SUPT5HO00267 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SUPT5HO00267 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SUPT5HO00267 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SUPT5HO00267 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SUPT5HO00267 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SUPT5HO00267 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SUPT5HO00267 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms