Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PCH4 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PCH4 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PCH4 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PCH4 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PCH4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PCH4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PCH4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PCH4 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PCH4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PCH4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PCH4 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PCH4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PCH4 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
E9PCH4 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PCH4 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PCH4 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PCH4 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PCH4 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PCH4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PCH4 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PCH4 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PCH4 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PCH4 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PCH4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PCH4 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PCH4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PCH4 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PCH4 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PCH4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PCH4 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PCH4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PCH4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PCH4 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PCH4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PCH4 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PCH4 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PCH4 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PCH4 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PCH4 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PCH4 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PCH4 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PCH4 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PCH4 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PCH4 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PCH4 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PCH4 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PCH4 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
E9PCH4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E9PCH4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E9PCH4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E9PCH4 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E9PCH4 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E9PCH4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
E9PCH4 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E9PCH4 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E9PCH4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E9PCH4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
E9PCH4 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E9PCH4 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E9PCH4 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E9PCH4 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
E9PCH4 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
E9PCH4 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E9PCH4 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E9PCH4 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E9PCH4 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
E9PCH4 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
E9PCH4 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
E9PCH4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
E9PCH4 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
E9PCH4 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
E9PCH4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
E9PCH4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
E9PCH4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
E9PCH4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
E9PCH4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
E9PCH4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
E9PCH4 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E9PCH4 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E9PCH4 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E9PCH4 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E9PCH4 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E9PCH4 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E9PCH4 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E9PCH4 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E9PCH4 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E9PCH4 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
E9PCH4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E9PCH4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E9PCH4 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
E9PCH4 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E9PCH4 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
E9PCH4 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E9PCH4 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E9PCH4 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
E9PCH4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
E9PCH4 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E9PCH4 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
E9PCH4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms