Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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SNX13Q9Y5W8 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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SNX13Q9Y5W8 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SNX13Q9Y5W8 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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SNX13Q9Y5W8 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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SNX13Q9Y5W8 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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SNX13Q9Y5W8 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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SNX13Q9Y5W8 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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SNX13Q9Y5W8 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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SNX13Q9Y5W8 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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SNX13Q9Y5W8 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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SNX13Q9Y5W8 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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SNX13Q9Y5W8 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SNX13Q9Y5W8 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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