Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAPPC8Q9Y2L5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms