Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
USP18Q9UMW8 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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