Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULL4

PLXNB3, Plexin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB3Q9ULL4 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PLXNB3Q9ULL4 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms