Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM5BQ9UGL1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms