Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HCN3Q9P1Z3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 513.9 ms