Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC20■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC20■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BRIP1Q9BX63 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms